SUPERGIRL/スーパーガール ＜サード・シーズン＞

モン＝エルとの別れが頭から離れないカーラ。スーパーガールとしての任務に全力を傾けることで、その悲しみを紛らわせようとする。結婚式を間近に控えたアレックスは、マギーにある秘密を打ち明ける。そんな中、ナショナル･シティの市民の１人と、カーラの間に不思議なつながりがあることが分かる。一方、レナは思い切った行動に出る。

ナショナル･シティで連続銀行強盗事件が発生。怪盗サイがサイキック攻撃を使って街を襲う。サイは恐怖心を利用して人々を何もできない状態にしてしまう。スーパーガールでもサイキック攻撃に対抗するためには、自身の恐怖心を克服しなければならない。そんな中、ジェームズとレナの関係は険悪になり、一方サムはL･コープで働き始める。

どうしても火星に戻ると言うジョン。スーパーガールも彼と一緒に行くことにする。ジョンは火星で父親との対面を果たすが、息子であることをなかなか認めてもらえない。一方、イライザ･ダンバース博士が、アレックスとマギーの結婚パーティーを開くことにする。マギーはずっと疎遠になっていた父親をパーティーに呼ぶ。

ある航空機の事故からすべてが始まる。スーパーガールと不思議なつながりを持つトーマス･コーヴィルが、カルト教団を結成する。教団のパンフレットにクリプトン星の神のシンボルが描かれていることを知ったカーラは、集会に潜入して驚くべき事実を知る。一方、サムは娘のルビーに寂しい思いをさせているのではないかと悩む。ジェームズはカーラに過去の秘密を打ち明ける。

子供たちが鉛中毒を発症。モーガン･エッジは、ダクサム人対策に鉛を放射する装置を作ったレナを糾弾する。予想外の事態に、レナは装置の設計に問題があったのではないかと思い、任務を降りる。レナの汚名をそそぐためにサムと真相を突き止めるカーラだが、そこには難しい事情が絡んでいた。一方、アレックスとマギーは互いの関係について大きな決断を下す。

カーラとアレックスは、気分転換にミッドヴェールの実家へと向かう。実家でカーラは、高校時代に友人が死亡した悲しい出来事を思い起こす。そのつらい体験をきっかけに、カーラとアレックスの姉妹の絆は深く結ばれることとなった。

ナショナル･シティの海中に飛行機が沈んでいるのを、ウィンたちが発見する。その飛行機が宇宙船であることが分かり、スーパーガールが調査に赴く。一方、ハンクは父親のミリンとの関係を深めようとする。サムは、自分の身に起こる変化の謎について手掛かりを得ようと、養母のパトリシアの元を久しぶりに訪れる。

「ARROW/アロー」「SUPERGIRL/スーパーガール」「THE FLASH/フラッシュ」「レジェンド･オブ･トゥモロー」、４話の壮大なクロスオーバー。バリー･アレンとアイリス･ウェストの結婚式にスーパーヒーローたちが集う。だがアースＸからの悪党たちに攻撃されたため、式は中断させられる。彼らはレオⅩやレイなどの力も借り、一丸となってこれまでで最も手強い悪党たちに立ち向かっていく。

ナショナル･シティの至るところに謎のシンボルが現れる。スーパーガールが調べると、そのシンボルは古代の象形文字で、ワールドキラーであるレインのマークだということが分かる。一方、モーガン･エッジとの間に緊張がますます高まるレナをジェームズが助ける。その時、ジェームズとレナの間にちょっとしたロマンスが芽生える。

レインに倒されたという心の傷が癒えずに苦しむスーパーガールは、昏睡状態のまま意識が戻らない。モン＝エルはカーラの状態を調べるため、リージョンのメンバーの１人、ブレイニアック５をカーラの意識の中に送り込む。一方、ナショナル･シティを襲い続けるレインの攻撃を止めるため、ＤＥＯはスーパーヒーローたちで構成されたリージョンと組む。

ナショナル･シティは、いまだレインの恐怖から逃れられずにいる。スーパーガールはレインの情報を求めて、サターン･ガールと、そしてかつての敵であるライブワイヤーやサイとも組み、ある人物が収容されているフォート･ロズに向かう。一方、ルビーからいじめの話を聞いたアレックスは、解決のために一肌脱ぐ。

命を狙われたものの、間一髪のところで助かったモーガン･エッジ。彼はそれがレナの仕業だと思い込み、彼女に宣戦布告する。レナはエッジへの憎しみから、ルーサー家の闇の世界に引きずり込まれそうになる。そんなレナにカーラが救いの手を差し伸べる。一方、記憶が飛んでいることに気づいたサムはアレックスに相談し、MRI検査を受ける。

ＤＥＯが２人目のワールドキラー、ピュリティを捕らえる。そしてスーパーガールとアレックスは、レインを倒す方法を見つけるために、全く異なる方法でピュリティを取り調べる。だがピュリティは逃走し、ナショナル･シティの地下鉄を襲う。一方ハンク、ウィン、モン＝エルの３人は、リージョン船を修理する。

ウィンは父親の葬儀で、消息不明だった母親のメアリーと再会する。メアリーは家を出た理由をウィンに説明し、彼との関係を修復しようとする。ウィンはつらかった子供時代を思うと母親を許すことができないが、“トイマン”を模倣した襲撃を受けたことで２人は協力し合う。一方、モン＝エルはワールドキラーに関する重要な情報をカーラに伝え、アレックスは最近のミリンの言動を心配する。

自身の症状を抑えるために力を使うミリン。その力が意図せず周りにも影響を及ぼし、その結果、ＤＥＯは混乱状態に陥る。スーパーガールはジョンと協力して、この騒動を収めなければならない。一方モン＝エルは、未来でのワールドキラーとの戦い方をカーラに伝授するが、その最中にカーラもミリンの力の影響を受けてしまう。

ハトの大量死に揺れるＤＥＯ。スーパーガールとイムラは、その元凶だと思われる３人目のワールドキラー、ペスティレンスの脅威から人々を守る方法をめぐって対立する。だが、アレックスとウィンがペスティレンスの魔の手にかかってしまい、スーパーガールとイムラは事態を食い止めるために手を取り合うことになる。

レナが密かにサムを調べていたことを知り、彼女への疑念を晴らせないスーパーガール。レナの言葉を信じていいのかどうかを確かめるために、スーパーガールはガーディアンにあることを頼む。だがそれは、彼とレナの関係を永遠に変えてしまう可能性があった。一方、ワールドキラーの３人が結託したため、スーパーガールたちは気持ちを引き締める。

レナが密かにサムを調べていたことを知り、彼女への疑念を晴らせないスーパーガール。レナの言葉を信じていいのかどうかを確かめるために、スーパーガールはガーディアンにあることを頼む。だがそれは、彼とレナの関係を永遠に変えてしまう可能性があった。一方、ワールドキラーの３人が結託したため、スーパーガールたちは気持ちを引き締める。

コーヴィルのカルト教団の信者ターニャが教団から逃走を図り、カーラとジェームズにコーヴィルの日記を渡す。この日記には、サムを守る鍵が隠されている可能性があった。一方、要求どおりにしなければ、ガーディアンの正体を世間に公表すると脅されたジェームズは、アメリカで黒人自警団員として活動することの意味を考えさせられる。

レインを消すために宇宙に向かうカーラとモン＝エル。思いがけず、生き残っていたクリプトン星人に出会う。カーラは大事な人との再会も果たすが、探し求めていたものを手に入れるには彼らを説得しなければならない。そんな中、ルビーと外出していたアレックスが攻撃される。レナはレインを閉じ込めておくために、どこまですべきなのか葛藤する。

ピンチを乗り越えたカーラは、アルゴ･シティでの出来事をアレックスに打ち明ける。カーラは一大決心をしてモン＝エルと共にアルゴ･シティに赴くが、悪の存在への不安感を取り除けずにいる。一方ナショナル･シティである事件が発生し、その事件には、ＤＥＯ用に製造されたものと同じ銃が使われていたことが判明する。

アルゴ･シティから突然姿を消したセレナ。その事情を調べていたスーパーガールとモン＝エルは、地球に対するセレナの恐ろしい計画を知る。地球に向かおうとするセレナを阻止する方法を探し出さなければならない２人は、アルーラと協力し合う。一方、ルビーはサムの様子がおかしいことに気づき心配する。ハンクは父親に永遠の別れを告げる覚悟を決める。

クリプトンの再興のため、セレナはレインを使って地球上の全人類の一掃を企てる。それでもスーパーガールはレインを殺すことを拒み、意外な人物から力を得たサムと共に、レインに立ち向かうのだった。圧倒的な強さを見せつけるレインから人類を守ることができるのか。地球をめぐってスーパーガールたちが壮絶な戦いを繰り広げる、ショッキングなサード･シーズン･フィナーレ。